На компе (не знаю точно, как реализован твой) должен быть импульсный источник питания. Его задача - разбросать питающее напряжение по разным датчикам. Т.е., на комп приходит общее напряжение при включении зажигания, и если импульсный источник работает некорректно, может это напряжение (или управляющее исполнителями) приходить не везде, или не всегда. Обычно это проверяется разрывом цепи. Но там много своих тонкостей и "в лоб" по схеме (не зная ее) я подсказывать не возьмусь
ЗЫ: попробуй спросить Artery - он спец в электронике и у него WJ.